1、藥師和主管藥師分別屬于不同領域，在衛生系統主管藥師屬于中級職稱，在藥監系統執業藥師是執業資格。
2、藥師是負責提供藥物知識及藥事服務的專業人員。藥師是藥物的專家，同時是解答市民大眾有關藥物問題的最適當人選。
3、藥師是由藥監局頒發的；主管藥師由衛生局頒發的。藥師是適用于所有藥房的；主管藥師只適用于醫院的藥房。
4、藥師的掛牌設立是全國對藥房管理的一種方式，主管藥師只是在醫院里的一種職稱評定。
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